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  Banco de Dados Ferramentas: Sciclips: Banco de ferramentas online


Anonymous enviou "Sciclips, um banco de dados de programas para bioinformática com mais de 2000 ferramentas online livre para pesquisadores."
 
 
  Postado por kishi em Quarta, fevereiro 17 @ 01:00:00 BRST (215 vizualização(ões))
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  Bioinformática Ferramentas: LUCY2 - Programa para trimar vetor, qualidade e poli A


Para quem trabalha com sequenciamento de DNA, com certeza tem que lidar diariamente com bases de baixa qualidade, contaminação e se for sequenciamento de ESTs, então tem um problema a mais, a cauda poli-A.

Para isso, uma ferramenta que auxilia nos trabalhos citados acima é o LUCY2, desenvolvido por um grupo na Iowa State University.
 
 
  Postado por cantao em Domingo, fevereiro 07 @ 01:00:00 BRST (221 vizualização(ões))
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  Informática Ferramentas: Gerando pacotes RPM com dir2rpm


poetbr enviou "
Esse script permite criar pacotes rpm a partir de um diretório de maneira muito simples.




"
 
 
  Postado por cantao em Segunda, janeiro 11 @ 10:54:36 BRST (163 vizualização(ões))
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  Bioinformática Ferramentas: Links para análises de sequências Online


Sites A - Z para análises de sequências Online:
 
 
  Postado por kishi em Quarta, outubro 14 @ 01:00:00 BRT (162 vizualização(ões))
(comentários? | Pontos: 0)
 

 
  Bioinformática Ferramentas: Bancos de Dados Biológicos


* COG - Banco de genes ortólogos
* GO - Banco para padronização e função de genes para anotação
* KEGG - Banco de vias metabólicas
* ECOCYC - Banco de genoma, trasncriptoma e vias metabólicas de E. coli
* SWISS-PROT - EXPASY - Banco de dados de sequências de proteínas e estruturas
* NCBI - Banco de dados de sequências primárias e secundárias
* PDB - Banco de estruturas de proteínas
* MIPs - Banco de sequências protéicas com o objetivo de análises genômicas
* PIR - Banco de dados de seqüências de proteínas não redundantes

 
 
  Postado por kishi em Sexta, setembro 18 @ 00:05:00 BRT (298 vizualização(ões))
(comentários? | Pontos: 0)
 

 
  Bioinformática Ferramentas: Filogenia Online


kishi enviou "
* WebPhylip - Scripts CGI-Perl para rodar o programa Phylip
* Blast2Orthologue - Ferramenta especializada para análises filogenéticas para identificação de ortólogos e parálogos
* Phylip - Programas free para inferências filogenéticas
"
 
 
  Postado por cantao em Quinta, setembro 17 @ 00:00:00 BRT (182 vizualização(ões))
(comentários? | Pontos: 0)
 

 
  Bioinformática Ferramentas: Comparações de Estruturas


kishi enviou "
* SCOP - Ferramenta para descrever relações estruturais e evolutivas entre proteínas de estruturas conhecidas
* CATH - Ferramenta para classificação hierárquica de domíneos de estruturas de proteínas
* PDBsum - Ferramenta para obtenção de informações estruturais
* Outras Ferramentas para predição de proteínas
"
 
 
  Postado por cantao em Quarta, setembro 16 @ 00:00:00 BRT (147 vizualização(ões))
(comentários? | Pontos: 0)
 

 
  Bioinformática Ferramentas: Predição de sequências


* Sequência complementar - Ferramenta para gerar uma sequência complementar
* Tradução de DNA para Proteína - Ferramenta para inferir uma sequência de proteína a partir de uma sequência de DNA
* Tradução de Proteína para DNA - Ferramenta para inferir uma sequência de DNA a partir de uma sequência de proteína

 
 
  Postado por kishi em Terça, setembro 15 @ 11:25:30 BRT (161 vizualização(ões))
(comentários? | Pontos: 0)
 

 
  Bioinformática Ferramentas: Alinhamento Global


kishi enviou "* ClustalW - Ferramenta para alinhamento múltiplo de seqüências
* Cinema - Editor para múltiplos alinhamentos
* Align - Ferramenta para alinhamento de sequências
"
 
 
  Postado por cantao em Terça, setembro 15 @ 00:00:00 BRT (173 vizualização(ões))
(comentários? | Pontos: 0)
 

 
  Bioinformática Ferramentas: Alinhamento Local


* Blast - Ferramenta para comparação com bancos de dados - NCBI
* Fasta - Ferramenta para busca de similaridade, similar ao Blast
* Blocks - Ferramenta para busca de similaridade de domínios de proteínas
* Prosite - Ferramenta para busca de motivos de proteínas
* Pfam - Ferramenta para busca de perfil de proteína utilizando HMM
* Interpro - Ferramenta para busca de assinaturas para inferir funções de proteínas 
* FingerPrintsScan - Ferramenta para busca de impressão digital de proteínas
 
 
  Postado por kishi em Segunda, setembro 14 @ 16:21:50 BRT (232 vizualização(ões))
(comentários? | Pontos: 0)
 




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