Para quem trabalha com sequenciamento de DNA, com certeza tem que lidar diariamente com bases de baixa qualidade, contaminação e se for sequenciamento de ESTs, então tem um problema a mais, a cauda poli-A.
Para isso, uma ferramenta que auxilia nos trabalhos citados acima é o LUCY2, desenvolvido por um grupo na Iowa State University.
Resumo:
Lucy2 é uma ferramenta visual para trimar seqüência de DNA. Os
usuários podem alterar os parâmetros, trimar múltiplas seqüências e
visualizar os resultados dentro de uma abordagem integrada, e com uma interface gráfica fácil de
usar.
Lucy2 foi projetado especificamente para usuários que não sabem/gostam de programação, totalmente visual e está
atualmente disponível nas plataformas Windows, Linux e MacOS X.
O código fonte
também está disponível quem quiser para portar para outras plataformas.
LUCY2 é um software de livre distribuição, que pode ser copiado e distribuído sob os termos da Licença Pública Geral GNUé distribuído sob a licença GNU (General Public License) e pode ser feito download em
http://www.complex.iastate.edu.
Contato: lucy2@www.complex.iastate.edu