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  Ferramentas: LUCY2 - Programa para trimar vetor, qualidade e poli A
Postado em Domingo, fevereiro 07 @ 01:00:00 BRST por cantao
 
 
  Bioinformática
Para quem trabalha com sequenciamento de DNA, com certeza tem que lidar diariamente com bases de baixa qualidade, contaminação e se for sequenciamento de ESTs, então tem um problema a mais, a cauda poli-A.

Para isso, uma ferramenta que auxilia nos trabalhos citados acima é o LUCY2, desenvolvido por um grupo na Iowa State University.


Resumo:
Lucy2 é uma ferramenta visual para trimar seqüência de DNA. Os usuários podem alterar os parâmetros, trimar múltiplas seqüências e visualizar os resultados dentro de uma abordagem integrada, e com uma interface gráfica fácil de usar.

Lucy2 foi projetado especificamente para usuários que não sabem/gostam de programação, totalmente visual e está atualmente disponível nas plataformas Windows, Linux e MacOS X.

O código fonte também está disponível quem quiser para portar para outras plataformas.

LUCY2 é um software de livre distribuição, que pode ser copiado e distribuído sob os termos da Licença Pública Geral GNUé distribuído sob a licença GNU (General Public License) e pode ser feito download em http://www.complex.iastate.edu.

Contato: lucy2@www.complex.iastate.edu

 



 
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